Zanim doszło do założenia Fall Out Boy, jego członkowie zdążyli się już dość dobrze poznać - wszyscy bowiem mieli za sobą epizody w chicagowskich, głównie hardcorowych zespołach muzycznych i zdarzało się, że przez krótki okres grywali ze sobą w tych samych kapelach. Pomysłodawcami oraz założycielami zespołu są dwaj starzy przyjaciele, Joe i Pete. Obaj współpracowali niegdyś w Arma Angelus (Wentz był liderem i wokalistą tego zespołu, Trohman grał w nim przez pewien czas na basie). To oni postanowili w 2001 roku, by wykorzystać swoje doświadczenie ze sceny hardcorowej i stworzyć nowy projekt, który będzie miał jednak bardziej pozytywne brzmienie. Pete zabrał się więc za pisanie bardziej popowych utworów. Tymczasem Joe przyjął do zespołu Patricka, którego spotkał pewien czas wcześniej w kawiarni (co ciekawe, Stump, który został mianowany wokalistą FOB'a, grał wcześniej w kilku mniej znanych kapelach na swojej uczelni, tyle, że na perkusji). Jeszcze w 2001 muzycy nagrali pierwsze demo, odbył się też wtedy ich pierwszy show. Wówczas anonimowi, na kolejnym swoim występie zapytali publiczność o propozycje nazwy dla swojego projektu. Traf chciał, że najgłośniej zareagował na to pytanie fan popularnej kreskówki The Simpsons, który krzyknął "Fallout Boy!" (imię jednego z drugoplanowych bohaterów). Kapela skorzystała z pomysłu - a że nie wiedząc, iż jest to odniesienie do kreskówki, nazwali siebie Fall Out Boy (czyli z lekkim przekręceniem). Takim sposobem zespół osiągnął solidne podstawy - czas było wypłynąć na szersze wody. Udało się to w maju 2002, kiedy to na rynku znalazł się pierwszy EP FOB'a, nagrany - wspólnie z kapelą Project Rocket - w studiu Uprising Records. Ta sama wytwórnia wydała pierwszy pełnometrażowy album zespołu - Fall Out Boy's Evening Out With Your Girlfriend - w styczniu 2003 roku. Roku, który okazał się przełomowym w karierze członków kapeli.